龙卷风说
从有关记载来看，麦田怪圈出现最多的季节是在夏天，有人认为，夏季天气变化无常，龙卷风是造成怪圈的主要原因。很多麦田怪圈出现在山边或离山六七公里的地方，这种地方很容易形成龙卷风。也有气象学家提出：大量尘埃包含在陆地上生成的小型龙卷风中，在风的作用下，尘埃与空气剧烈摩擦产生静电荷。神秘怪圈就是在带有静电荷的小型龙卷风的作用下产生的。
磁场说
有专家认为，磁场中有一种神奇的移动力，可产生一股电流，使农作物“平躺”在地面上。美国专家杰弗里·威尔逊研究了130多个麦田怪圈，发现90%的怪圈附近都有连接高压电线的变压器，方圆270米内都有一个水池。由于接受灌溉，麦田底部的土壤释放出的离子会产生负电，与高压电线相连的变压器则产生正电，负电和正电碰撞后会产生电磁能，从而击倒小麦形成怪圈。
预告说
一些人相信，麦田怪圈背后有种神秘的力量，就像百慕大三角一样。根据这种猜测，有人认为麦田怪圈是“灾难预告”。
高频辐射说
俄地质协会成员斯米尔诺夫决意解开此谜。斯米尔诺夫从麦田里捡了一些荞麦秆，并把它们带回自己的实验室。他把荞麦秆放进微波炉里，然后加入一杯水，在600瓦的高频辐射下，经过12秒钟，荞麦秆发生了奇异的变化，所有试验的麦秆都在节瘤处发生了弯曲，其形状与陶里亚蒂麦田里倒伏的麦秆完全一样。斯米尔诺夫因此得出推断，陶里亚蒂的麦田一定是受到了高频辐射，但哪儿来的高频辐射呢？斯米尔诺夫认为，也许来自地球内部的磁场变化。
俄电工学院的专家阿尔将耶夫的观点与斯米尔诺夫正好相反，他认为高频辐射来自闪电。阿尔将耶夫称，高频辐射使草本植物发生规律性倒伏并不稀罕，50年前他们就在学院的草坪上干过这事。当年，阿尔将耶夫与两名年轻的助手一起在学院的草坪上试验高频设备，当悬在草坪上的高压电缆被接通时，电缆下方的草坪立刻呈顺时针方向倒下，形成一个极其规律的圆圈。阿尔将耶夫解释说，当电缆通电时，草坪被电磁化，此时的草坪相当于电机里的定子，而电缆是转子，在电磁扭力的作用下，草坪上的草便发生扭曲。阿尔将耶夫认为，电缆所产生的电磁现象相当于人造闪电，而大自然的闪电更加奇妙，它会产生更加复杂的电磁场，因而也就可以画出更加奇妙的图案。
关于麦圈这一神秘现象的形成，阿尔将耶夫与斯米尔诺夫两位学者的观点似乎都很有说服力，不过，就算麦圈是高频辐射现象所为，但两人都没有证实，高频辐射来自哪里，是地磁现象？还是天空闪电？
1.外太空粒子束或能量束击打造成。大自然是鬼斧神工的最大制造者，在短时间内创造出如此大且规则的杰作而不被人察觉，人为制造的可能性非常低；另外怪圈出现在地球的能量带处且植物和土壤有明显变异特征，可以判断绝不是机械手段造成的，而最大的可能性是受到外太空飞来的粒子束或射线束的击打造成的。综上，怪圈很有可能是来自外太空的能量束受到地球磁场的影响后发散击打造成的。
2.英国二战时期的文件认为，“麦田怪圈”是纳粹特工所为，据20日《每日快报》报道，遍布英国各地的神秘“麦田怪圈”神秘莫测，其成因至今仍是未解之谜，甚至有人认为它是外星人的杰作。但一批最新解密的军情五处(mi5）二战文件得出惊人观点：“麦田怪圈”最早是纳粹的秘密特工发明创造，其用意是为纳粹空军的轰炸机空投炸弹或者伞兵部队降落提供记号。这一惊人密闻是从英国国家档案馆最新公布的一批军情五处（mi5)二战时期的文件中披露的。该文件称，二战期间，英国南部麦田和玉米地里，开始出现大量来历不明的“地面标志”。
一份名为《地面标记调查案例》的文件显示，1940年5月，飞行员发现康沃尔郡北纽奎地面曾出现奇怪标记，并拍下照片。对照片研究后发现，那些标记是由农业用石灰按规律堆放而成。1941年5月，蒙矛舍郡地区的玉米田中，出现一个不寻常的标记，大约30米长，好像是一个大写字母‘g’。1943年10月，肯特郡附近，飞行员看到地面出现一个巨大白圈。据报道，这些来历不明的“地面标志”，让当时正处于战争中的英国情报部门如临大敌。公布的文件称，1941年当大卫·佩特里被任命为mi5主管之后，他奉命对此进行调查。据称，为了查明真相，mi5不仅暗访了多名英国各地农夫和空军官员，而且与各盟国密切合作调查。
令mi5震惊的是，几乎与此同时，在欧洲各地也陆续出现了类似神秘标志。文件写道：“波兰、荷兰、法国和比利时都不断有报告称，当地发现了奇怪标记——如涂刷特别颜色的屋顶，白色烟囱，或者是将亚麻布拼出特别的图案等。”最令mi5调查者震惊的是波兰盟军提供的情况，据称，波兰曾出现过一大片“直径大约20米”的被割倒的玉米田。解密文件显示，缜密调查之后，mi5终于得出结论：这些出现在英国和欧洲各地的所谓的“麦田怪圈”，是纳粹秘密特工的“杰作”。
它们很可能是纳粹德军互相联系的方式，用来为轰炸机和伞兵部队导航。文件称：“‘麦田怪圈’中很可能隐藏着某种加密的特殊信息，而且很容易从空中观察到，而这正是纳粹将之作为联络工具的重要原因。”
麦田圈是怎么形成的，长期以来是一个谜。1989年6月，人们进行了“白鸦行动”，希望抓捕到麦田圈制造者，却更加增添了麦田圈的神秘色彩。