既然王树亭已经有了决定。
接下来便是挑选黄道吉日，建社稷、立宗庙，正式就任唐国公、文武大将军；文武百官恭贺并传檄陕地四府、七州，四十九县。
就任之后，就是敲定大将军府和唐国公府的各级文武官员的级别和职能了。
又经过几天的商议，最终确定制度在唐制和明制的基础上进行改建，
大将军府：由王树亭直接领导，其下设立指挥部、参谋部、后勤装备部三个主要部门。
指挥部：设前后左右四卫将军和内卫将军，负责统带所有作战部队和内卫部队。
任命王树山为左卫将军，冯举、万宏权为副将；王壮为右卫将军、艾穆、刘成功为副将；苏步为前卫将军，叶孟至、平安为副将；苗兴一为后卫将军，万宏权、萧动为副将；李本原为内卫将军，副将牛成虎，崔尔达。
参谋部：设参谋总长、参谋次长、及各事参军等负责作战参谋和命令传达。
任命：黄文瀚为参谋总长。
后勤装备部：设司务将军、仓曹司、兵曹司、骑曹司，负责粮食、装备等物资的筹措和发放。
另设大将军府长史、司马负责协助大将军处理各类事务。徐平川和张国绅为长史和司马。
王树亭成了唐国公，那麾下军队，不管是护乡军还是归降的明军自然就统一变成了唐军，当即命令参谋部重新整编全部军队，现在全军所有兵马加在一起差不多有十三万人马，要求前后左右四卫为野战部队，每卫两万人马，兵员配备按照火器四成、骑兵三成、战兵两成、炮兵一成的比例组建。
剩余五万人马全部归内卫将军统带，驻守城池。
唐国公府：
唐国公府设总理大臣、左右长史和左右司马负责辅助王树亭总揽事务，相当于朝廷的内阁，大将军府长史和司马分别兼任内阁的长史和司马。
任命徐平川为总理大臣，黄文瀚、张国绅、张辇、杜正川为左右长史和左右司马，五人共同组成内阁。原来担任的职务卸任，分别由黄文锦担任延安知府、侯宁担任西安知府、宋千山担任庆阳知府。
内阁之下直接设立六部：
吏部掌管全国文职官吏的任免、考课、勋封等事；
户部掌管全国户口、土地、赋税、钱粮、财政收支等事；
礼部掌管礼仪、祭祀、科举、学校等事；
兵部掌管武官选用及军事行政；
刑部掌管全国司法行政；
工部掌管各项工程、工匠、屯田、水利、交通等事。
在官阶之上，文职，内阁成员为从二品，六部之首尚书为正三品，副职称侍郎从三品，下面还有各司之首称司长正四品，副职为司丞从四品，之后再是各科主事正七品。地方上，一府知府为从三品，同知正四品、通判正五品，其下还有府衙各房主事，一县之县令为正七品、县丞 从七品、主簿 正八品、典史正九品。
武职方面，五卫将军和参谋总长从二品、副将、将军府长史、司马和司务将军正三品，卫指挥同知、参谋次长从三品，参将正四品，正千户 正五品，副千户 从五品，百户正六品。
这基本是就是照抄了大明朝廷的官职设置，只是因为他们现在手里可用的官员比较少，只能一人身兼数职。
事情定下来是很好定的，可是之后具体的事务处理就难了，主要是繁琐。
新的军制编成，需要将军们适应，也需要士兵们适应，通过整编训练之后才能形成战斗力，将军府参谋部也不准备一次性都整编完，先从西安城的四万驻军开始，等西安驻军整编完毕后，再替换其他地方的驻军回来整编。
更加繁琐的就是政务上的处理，有了内阁，王树亭倒是闲下来不少，可是徐平川、黄文瀚、张国绅等内阁成员就忙疯了，要重新筛选任命各级官员、要鼓励百姓耕种土地，要敲定税收劳役、要确定法令、要鼓励经商、要生产军械、要兴修水利等等等等，都需要他们操心，虽然事情不是一次可以办完的，但是待办事宜的条陈都堆满了他们的办公桌。
作为一方势力的开元之臣，不管是王树亭的旧部还是大明的降官都爆发出了极大的工作热情，没日没夜的辛勤工作，当然王树亭也没有亏待他们，得了秦王府那么多的财物，自然是要花出去，首先就是把各级官吏的薪俸整体提高了一倍，还接受徐平川的建议在每个部门都设置了公务银，只要不超过标准，所有的公务花费都是由户部承担，官员的薪俸完全就是能到自己腰包里的银子了，当然对于贪污腐败的稽查也成立了专门的部门。
这么一折腾时间很快两三个月就过去了。
这天在唐国公府，现在秦王府已经改成唐国公府了，在唐国公府总理衙门的办公桌后，从高高的文件堆里抬起头来的徐平川，盯着一双熊猫眼，无助的哀嚎道：“这还有没有完啊，怎么还有这么多，没有把人当牲口使的！真是要命啊！”
“哈哈哈，总理大人，你就不要再叫苦了，这年纪轻轻的就吃不消了，你看我和两位张阁老都已经年近半百了，不还是在挺着！”杜正川也抬起头，哈哈笑着看着这位年轻的总理大人。
“我都熬了好几个月了，连家都没有回过，你闻闻，我身上都馊了！”徐平川拿袖子扇了扇自己身上传出来的味道。
另外四人也下意识的闻了闻自己身上的味道，果不其然，一股酸臭的味道从身上传来，立时就都皱起了眉头。
“明天咱们休沐两日吧，一直这么熬下去不是办法啊！”徐平川建议道。
“也好，是该休息一下了，一会咱们联名给国公上个条陈，问题还是咱们现在可用的官员太少了，我觉得应该是把招贤和科举提上日程了！”张辇建议道。
“这个事情不是不能考虑，可是就咱们现在的四府之地，会有多少文人士子来应募，如果到时候没人来咱们可就坐蜡了，唐公的脸面上也不好看！”张国绅有些担心的说道。
“现在咱们在册的士子有多少？”
“在册有秀才功名的是六百八十人，举人功名的四十七人，生员大约有两千多人，能来参加考试的估计过不了半数，再筛选一番怕是留不下几个人啊！唉！”张国绅叹了一口气。
“怎么这么少？怕是一个县都分不到二十个秀才吧！这要是江南文盛之地，怕是一个府就有这么多读书人了！”徐平川有些感慨。
“陕西连年灾荒兵乱，能保留下这么多的读书人已经是侥幸了”
“我就得办还是要办的，不行就放宽一些条件，优秀者留在中枢，差一些的下放到地方边任事边学习吧！”张辇建议道。
徐平川在房中转悠着琢磨了半天：“不行咱就再放开一些，将各府县的吏员，也纳入到考核范围之内，只要有才干就给他们一个任官的机会，这总比光读死书的秀才们会治理地方吧！”
“这倒也是个办法，不过这些吏员多半都是当地氏族子弟，盘踞本县日久，让他们任事需要规定不得在本县任职，以防公报私囊！”张国绅说。
“嗯，我咱们张阁老的建议，诸位觉得如何？”徐平川问。
其余几人也都表示赞同，黄文瀚和杜正川之间并没有太多对官场上的经验，这是有也是只能听着，其实徐平川也没有，不过他作为总理大臣就是要综合各方建议，然后总结出一个来。
“好如此那边定下来了，正川你起草个文书，咱们几个都签名上报，至于招贤馆可以先选地方修缮起来，等考生们到了西安好有地方住，也要传谕各级官吏，有什么好的人才要多多推荐上来。”徐平川安排道。
一直又忙到了下午傍晚时分，有小太监将他们起草的文书都送了回来。
徐平川打开一看，关于招贤的表章上，已经加盖了打印；他们要求休沐的条陈上王树亭也做了批复：诸位辛苦了，劳逸应当结合，准休沐三日，以后形成定例每七日休沐一日，一月四日。
一拍桌子，徐平川笑道：“好了，大家伙，放下手头的工作吧，咱们放假了，三天假期，以后每月四天带薪休假！不要紧的事情等休假回来以后再说，走起几位一起去喝个酒啊！”
徐平川邀请，众人肯定不会拒绝，于是都将纸笔放下，整理官服出了总理衙门，至于那些公文，自然是由小吏收拾好。