赵轩带着少数亲信，悄然离开京城，直奔江南。此行的目的是亲自调查“新天命教”的叛乱真相，并稳住江南的局势。一路上，赵轩低调行事，未曾惊动地方官员，只带了一队精锐的锦衣卫，确保行动的隐秘性。
抵达苏州后，赵轩首先会见了李振国，听取了他关于江南局势的详细汇报。李振国告诉赵轩，“新天命教”虽然表面上是宗教叛乱，但背后却有着极其复杂的政治动机和外部势力的支持。他们利用江南的粮荒和地方豪强的不满，迅速集结了一批死士，并得到了一些流亡在外的前朝遗老的暗中支持。
赵轩心中愈发警觉，他知道，表面上的宗教叛乱往往是掩盖真正目的的烟幕。这场动乱背后的深层次原因，可能与满洲和西方列强的活动有关联。他决定亲自深入江南各地，暗中了解民情，并寻求打击叛乱的最佳时机。
为了不引起叛军的警觉，赵轩化身为一名普通的官员，在李振国的陪同下，走访了苏州、杭州和南京等地。他看到，虽然表面上这些城市仍在朝廷的控制之下，但民心动摇，叛军的宣传广泛流传，许多百姓开始对朝廷失去信心。这种情形让赵轩心情沉重，他意识到，必须尽快采取行动，扭转局势。
在杭州，赵轩秘密召见了一些地方的忠诚官员，详细了解了他们对“新天命教”的看法和对策。这些官员一致认为，叛乱之所以能迅速蔓延，除了宗教信仰的蛊惑，更在于地方豪强的支持。这些豪强通过操控粮食市场，激化了民众的不满，进而推动叛乱。
赵轩当即下令，要求李振国彻查这些豪强的背景，并准备对其进行一次全面的清剿。同时，他决定以杭州为中心，展开一场大规模的反叛宣传运动，通过恢复民众对朝廷的信任，削弱“新天命教”的影响力。
在南京，赵轩发现了更为严重的问题。当地的叛军不仅控制了部分乡村，还开始向城市渗透，一些叛军甚至伪装成商贾，潜入城中，伺机煽动暴乱。赵轩立即命令加强南京的城防，同时在城内设立秘密巡查队，严密监控可疑人物。
一天夜里，赵轩亲自带领锦衣卫潜入南京郊外的一个叛军据点。这里原本是一个废弃的寺庙，如今却被改造成了“新天命教”的秘密基地。赵轩亲眼目睹了叛军如何在此进行军事训练，并宣扬反叛思想。他的内心愈发坚定，这场叛乱绝不能拖延，必须迅速剿灭。
赵轩的行动十分谨慎，他没有立即下令进攻，而是让李振国继续收集情报，等到时机成熟，再发起一次彻底的围剿行动。与此同时，赵轩开始在各地布置防线，调集军队准备应对可能的全面战争。
不久后，李振国带来了关键情报：一些地方豪强与“新天命教”有密切联系，他们不仅提供了大量的资金支持，还帮助叛军招募兵力。这些豪强中，有几人甚至与满洲和南洋的外敌暗中勾结，试图利用这场叛乱削弱朝廷的统治，甚至伺机夺取权力。
赵轩终于明白，这场叛乱背后隐藏着更为深远的阴谋。满洲、南洋的西方列强、江南的地方豪强，三方势力合谋，试图通过“新天命教”这场叛乱，制造大明的内乱，从而实现他们各自的野心。
赵轩的脸上浮现出一丝冷笑，他决定以雷霆手段迅速剿灭这场叛乱。他命令李振国在全国范围内发起一次秘密逮捕行动，将那些与叛军勾结的地方豪强一网打尽。同时，他下令调集大军，以迅雷不及掩耳之势对“新天命教”的核心据点展开全面围剿。
几天后，赵轩亲自指挥的剿灭行动正式开始。在江南各地，朝廷军队以压倒性的优势围剿叛军据点。南京郊外的那座废弃寺庙，成为了叛军的最后堡垒。赵轩亲自坐镇指挥，命令部队围而不攻，待叛军弹尽粮绝之时，再一举攻破。
经过几天的围困，叛军终因缺乏粮草而崩溃。朝廷军队在赵轩的指挥下，发起了总攻，叛军被彻底消灭，残余势力也被锦衣卫逐一清理干净。江南的局势终于得到了控制。
叛乱平定后，赵轩下令对“新天命教”进行彻底的清查，凡参与其中者，严惩不贷。同时，他加大对地方豪强的打压，彻底清除了那些试图利用叛乱谋取私利的势力。
江南的叛乱虽然平定，但赵轩心中清楚，这场风暴背后的阴谋远未结束。他知道，满洲和西方列强的威胁依然存在，朝廷内部的反对势力也在暗中蠢动。为了大明的未来，赵轩必须更加坚定地推行改革，并以更强的手段应对来自内外的挑战。
夜深人静，赵轩站在南京城楼上，俯瞰着这座刚刚经历战火洗礼的城市。他的心中既有胜利的满足，也有未来的忧虑。
“朕已准备好迎接更大的风暴。”赵轩低声自语，目光坚定如初。
江南的风云虽然暂时平息，但赵轩知道，真正的考验还在后面。